以下是污水处理常用的几种消毒技术的对比(表)
| 消毒方式 | 优点 | 缺点 | 适用条件 |
| 紫外线消毒 | 符合环境保护要求，不会产生三卤甲烷等“三致”物质；杀菌迅速。无化学反应接触时间短，土建费用少；运行成本低，占地面积小 | 杀菌效果受出水水质影响较大，没有持续杀菌能力 | 大、中、小型污水处理厂二级生化处理后的污水 |
| 液氯消毒 | 效果可靠，成本较低；投配设备简单，投量准确 | 易产生“三致”物质，氧化形成的余氯及某些含氧化合物对水生物有毒害 | 大、中、小型污水处理厂二级生化处理后的污水、再生水 |
| 二氧化氯消毒 | 具有较好的消毒效果，不会产生“三致”物质 | 不能储存，现制现用，制取设备复杂，成本较高 | 中、小型污水处理厂常南段二级生化处理后的污水和再生水 |
| 臭氧消毒 | 消毒效率高，不产生难处理的或生物积累下余物 | 投资大，成本高，设备管理复杂 | 常规二级生化处理后的污水/再生水 |
